و يقع مركز وادي النطرون جنوب غرب محافظة البحيرة، حيث يحد مدينة وادي النطرون
من الشمال:(محافظة البحيره ) مركزي بدر وأبو المطامير.
من الشرق:( محافظة المنوفيه ) مدينة السادات.
من الغرب: ( محافظة مطروح ) مركز الحمام بمحافظة مطروح.
من الجنوب: (محافظة الجيزه ) مدينة السادس من أكتوبر